印度尼西亚政府（Government of Indonesia）旗下包括行政部门，立法部门和司法部门。印尼政府负责管理印尼国家日常事务和立法。

印度尼西亚总统和副总统任期五年，可以连任两届。印尼最高国家机构是印尼人民协商会议，以前职能包括选举总统和副总统（自2004年以来，总统一直由人民直接选举产生），建立国家政策和指导方针，并修改宪法。