冲绳科学技术大学院大学（Okinawa Institute of Science and Technology）是日一所跨学科的研究生院，该大学位于日本冲绳县恩纳。大学提供5年制博士课程。半数以上的教师和学生都来自日本以外的地区，并使用全英语模式来教学。

冲绳科学技术大学院大学没有设立部门，其研究人员开展多学科研究，覆盖：神经科学、数学与计算科学、物理学、化学、综合生物学和分子学、细胞和发育生物学。该大学非常依赖日本政府支付的公共补贴。日本政府主要通过两方面补贴：补贴运营和设施补贴。

冲绳科学技术大学院大学在2011年11月1日成立，总裁为Jonathan M. Dorfan，625名工作人员，财政预算案为198亿日元。